- La garriga de acebuche y el sabinar costero: La garriga de acebuche (también conocida con el nombre de maquia) se extiende en Mondragó siguiendo la costa, especialmente en la parte más rocosa. Cuenta con las siguientes especies acompañantes principales: el pino, el lentisco -mata-, la jara -estepa- y la labiérnaga -aladern de fulla estreta-. Es una formación vegetal muy importante en las islas, ya que ocupa una gran parte del territorio natural y está perfectamente adaptada a las condiciones climáticas mediterráneas, con una sequedad veraniega muy larga e intensa.Este enclave de la costa mallorquina se caracteriza por ser rico en un arbusto, la sabina, la cual se sitúa siempre próxima al mar. La destrucción que ha padecido en los últimos años el litoral en las Baleares y, en general, en el Mediterráneo occidental, ha obligado a proteger los últimos reductos de sabinar costero existentes y a incluir la especie en el Catálogo balear de especies vegetales amenazadas (con lo cual se protege legalmente).

Son las comunidades más valiosas del Parque, por su escasez en el litoral de Mallorca. El herbazal de Ruppia maritima se encuentra en las aguas salobres de s'Amarador y de sa Font de n'Alis. Las salicornias, con sus diferentes variedades, crecen en los alrededores de las dos lagunas. El carrizal, que contiene una considerable población de carrizo común y algunos pies de enea, rodea completamente en estanque de s'Amarador; en sa Font de n'Alis el carrizo es escaso.- El encinar: En la mitad del barranco de s'Amarador se encuentran restos de encinar. Este tipo de bosque está muy fraccionado actualmente y casi siempre se arrincona en torrentes o parajes protegidos y un poco húmedos. Además de la encina, podrá ver también especies acompañantes como la madreselva, el majuelo -cirerer de Betlem- o la esparraguera de sombra.

La garriga de lavanda y brezo. No es en Mondragó una comunidad frecuente, ya que sólo se encuentra en los lugares más escarpados de los barrancos. Las especies presentes son la lavanda, el brezo y el romero.

La vegetación dunar. Se encuentra principalmente en la playa de s'Amarador, donde hay una mayor extensión de arena. Sin encontrar una estructura dunar bien desarrollada, en el Parque de Mondragó podemos observar algunas especies propias de los lugares arenosos, como el cardo marino, la azucena de mar y la manzanilla bastarda.

Se ha constatado la presencia de algunos escarabajos de la familia de los tenebriónidos endémicos de las Islas Baleares. Otras especies presentes son la salamanquesa, el dragonet y la serpiente de tierra. La tortuga de tierra está extinguida en la zona de Mondragó, pero desde 1985 se están liberando ejemplares dentro de un proyecto de reintroducción de la especie.